Unité d'Epidémiologie Animale

Rôle de la diversité des hôtes et des agents pathogènes dans la dynamique de transmission des agents pathogènes

Des progrès indéniables sur la connaissance de la dynamique de transmission des pathogènes ont été atteints grâce au développement de modèles épidémiologiques concernant un pathogène infectant une espèce d’hôte. Le défi est à présent de comprendre la dynamique des systèmes épidémiologiques qui impliquent plusieurs espèces d’hôtes et/ou plusieurs espèces de pathogènes. En effet, tous les organismes vivants sont exposés à plusieurs agents pathogènes. Parallèlement, il apparaît que l’aptitude des pathogènes à infecter plusieurs espèces d’hôtes est plutôt la règle que l’exception, puisque la majorité des agents pathogènes sont multihôtes, en particulier les pathogènes impliqués dans les émergences de maladies. Or, les changements actuels subis par notre planète ont à la fois des conséquences globales et locales sur la diversité des hôtes et des agents pathogènes. Il en dérive des changements au sein des interactions impliquant les hôtes et les agents pathogènes, à tous les niveaux d’organisation, y compris sur les écosystèmes.

Dans ce contexte, nous étudions plus particulièrement d’une part les conséquences de la modification des communautés d’hôtes dans la dynamique de transmission des pathogènes et d’autre part les conséquences épidémiologiques de la variabilité génétique des agents pathogènes. Pour cela, nous travaillerons sur plusieurs systèmes pathologiques impliquant plusieurs espèces hôtes et/ou plusieurs agents pathogènes. En particulier, nous travaillons sur les agents pathogènes transmis par les vecteurs (tiques et moustiques) ainsi que certains à transmission directe ou mixte (hantavirus, fièvre Q, leptospires).

• Eco-épidémiologie des maladies bactériennes transmises par les tiques dures Ixodes ricinus - stratégie d'échantillonnage des tiques à l'affût
  
  
• Approche bayesienne pour estimer des abondances et un taux d'échantillonnage à partir de prélèvements successif
  
  
• OSCAR
  
  
• PATHO-ID : Rodent and tick pathobiome
  
  
• EDENext
  
  
• Génomique des populations de Borrelia burgdorferi sensu lato
  
  
• Etude des interactions entre agents pathogènes transmis par les tiques chez leurs hôtes naturels
  
  
• Identification du vecteur de l’anaplasmose granulocytique équine en Camargue
  

• Etude du rôle du tamia de Sibérie (Tamias sibiricus) sur le risque de maladie de Lyme en forêt périurbaine
  

• Le système Néphropathie épidémique/hantavirus puumala/campagnol roussâtre, un modèle de zoonoses
  
  
• Eco-épidémiologie de la fièvre Q due à Coxiella-burnetii dans les élevages de petits ruminants
  

•  Epidémiologie moléculaire
   
  
• La modélisation statistique des cycles épidémiologiques complexes